荷兰Oncode研究所Alexander van Oudenaarden小组取得一项新突破。他们利用单细胞sortChIC揭示了造血过程的染色质动力学。2022年12月20日出版的《自然-遗传学》杂志发表了这项成果。

　　研究人员开发了分选辅助单细胞染色质免疫切割（sortChIC），并在小鼠骨髓中绘制了激活性（H3K4me1和H3K4me3）和抑制性（H3K27me3和H3K9me3）组蛋白修饰。在分化过程中，造血干细胞和祖细胞（HSPC）具有细胞类型特异性转录因子介导的活性染色质状态，这些转录因子对于每个谱系都是唯一的。相比之下，分化过程中大多数抑制性标记的改变与最终细胞类型无关。

　　染色质轨迹分析表明，染色质水平的谱系选择发生在祖细胞阶段。H3K4me1和H3K9me3的联合分析表明，骨髓来源的细胞类型具有不同的活性染色质，但具有相似的髓系特异性异染色质状态。这意味着造血过程中存在染色质的分层调节：异染色质动力学区分分化轨迹和谱系，而常染色质动力学反映谱系内的细胞类型。

　　研究人员表示，组蛋白翻译后修饰通过改变染色质活性来影响基因表达。尚不清楚染色质状态如何影响单细胞谱系选择的机制。